2018年11月29日 星期四

不是真懂,就不要假會,更不該亂搞系統核心。這個亂搞人類基因的王八蛋,也是一樣!

實在是胡搞!這讓我想起以前公司的一個同事,他負責開發崁入式系統,需要精簡所用的視窗OS,或者付錢去買很貴的微軟崁入式視窗OS的授權。結果呢,他保留所謂普通版視窗核心模組,砍掉他看不懂功能的所謂無用模組,用他自寫的模組取代,把他說的爆肥微軟視窗OS瘦身為1/3大小,效率提升不只3倍,然後跑公司的應用程式一陣子,發現都沒問題,就讓公司把這崁入式系統軟硬體交貨,在客戶處上線去了。
結果呢,上線沒幾天,客戶就客訴要求退貨賠錢,因為系統時常無故當機,而叫修多次,公司的工程師仍然找不到系統時常無故當機的原因,當然也無法進行維修,解決方法就是重開機,然後與客戶一起開始祈禱。最後系統被退回來後,該組人員仍然一直找不到系統會無故當機的原因。我受邀去看看,發現該系統會無故當機的原因,是系統定時起來自我檢測時,或收到內部或外部非正常訊息等事件時,系統內建的所有異常或緊急處理邏輯,都被這偉大的同事幹掉了,所有模組都在等待對方回覆,這系統不當機才奇怪!
不是真懂,就不要假會,更不該亂搞系統核心。這個亂搞人類基因的王八蛋,也是一樣!
火星軍情局
簡單說明基因編輯嬰兒事件是怎麼回事。
話說回來,科學界對這「代碼」還算有些了解,賀建奎刪掉的那兩行也確有所本,對我來說最大的問題是:那程式和電腦都不是你的,你不但改了還傳上網!


Othala Huang 這件事噁心的地方是,他還刪錯行。(Lulu 一條CCR5是WT一條是-15bp,nana是-4bp/+1bp,都不是少數歐洲人缺失的-32bp)



圖像裡可能有1 人、文字-----
賀建奎這個"第一",彷彿打開了潘多拉盒子,至於盒子裡面還有什麼,沒有人知道。
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中国一名生物学家称对自己修改人胚胎基因的实验感到自豪。与此同时,中国生物研究权威机构加入了众多国际学者的行列,对这一基因编辑实验提出批评。https://goo.gl/xCi4Ur
#基因修改 
#贺建奎

VOACHINESE.COM
中国一名生物学家称对自己修改人胚胎基因的实验感到自豪。与此同时,中国生物研究权威机构加入了众多国际学者的行列,对这一基因编辑实验提出批评。

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#好像回答了很多但其實什麼也沒說
#大概就是所謂說話的藝術
 
延伸閱讀:
史上第一對經過基因編輯的嬰兒誕生了?面對 CRISPR技術,要討論的議題有哪些?
https://pansci.asia/archives/150726
編輯基因的超級瑞士刀:CRISPR 技術──《基因編輯大革命》
https://pansci.asia/archives/148687

PANSCI.ASIA
引發軒然大波的賀建奎出席了在香港舉辦的第二屆國際人類基因組編輯峰會,他表示經過基因編輯的雙胞胎──露露和娜娜已經平安出生,根據出生後的定序,並沒有發現脫靶造成的突變。不過,相關研究倫理的問題他則含糊帶...

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北歐心科學 NordicHearts
4 小時
【倫理只拖科學後腿?】
#不明白就吊到你明白為止
好有些人,讀也不讀反駁觀點,就中二病起來,就說全世界反對這實驗,是因為落後,是因為不夠前衛,說道德倫理只會拖科學後腿,只是人的觀念。
鬼唔知道阿媽係女人?鬼不知道倫理是人的觀念?倫理是人類多年演化後的結果 (可參考Jordan Petterson教授的觀點),而且有部份是密秘的,無法完全用理性考驗,例如為何我們不接受亂倫,不接受人獸交等等。這些倫理是人類社會特性,不是不能改變,但隨意大變動,就有機會帶來重大影響,例如上世紀的優生學,共產主義等,we simply did not evolve this way。
而很多科學家、倫理學家及大眾對這次的批評,是基於恐怕如此魯莽的舉動,會帶來人類行為及社會的範式轉移。我們想過這些後果嗎?願意接受這些後果嗎?就算你多麼期待基因改造人的美麗新世界,我們也絕未夠時間思考應否及如何踏進這領域。
有說,「疫苗」「人工受孕」「器官移植」等等,都曾被視為洪水猛獸,是當時的人落後啊。那我問,難道發展這些科技時,我們未曾考慮過疫苗安全、代孕的道德問題、器官買賣的危險等等?再成功的科技,也要衡量相應的安全及倫理因素啊!
上世紀社會,覺得優生學就是最科學最前衛,一百年過去,我們今天都接受了優生學嗎?以前不人道的心理學實驗、動物實驗、黑太陽731、納粹科學,很前衛啊,我們今日都接受了嗎?For Science! Right?
Science serves us. We don’t serve science.(除非你是博士生,博士生是科學的奴隸🤦🏻‍♂️
好了,就算不理會這些倫理問題,只為科學了,過於進取有利科學嗎?我用九十年代的基因療法做例子。基因療法曾被視為人類的希望,很多奇難雜症,都要在基因層面治療。九十年代末,有科學家為了醫治嚴重綜合免疫缺乏症(SCID),用反轉譯病毒將轉基因引入病童細胞,結果導致兩名病童患上白血病,估計是病毒將基因胡亂插入基因組,意外破壞正常基因,產生癌細胞。自此以後,公眾恐懼基因療法,基因療法的臨床測試很多取消了,新的臨床測試也面臨超嚴格的門欖,加上被削減研究資金,基因療法停滯了近十年!
這就是你想要的結果嗎?別忘記,我是Scientist,我就是靠推動科學及科技食飯的,我比你更希望科技普及。但這亦代表,我們更有責任,推動安全且合乎倫理的科學發展。
技術批判在此,讀完再反對我,好嗎?
https://www.facebook.com/1586779741564688/posts/2214971612078828?sfns=1
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賀建奎是一個真正的人渣與垃圾!
北歐心科學 NordicHearts
23小時

【更新】【基因改造嬰兒事件】【當事人出現了】
#2018人類基因組編輯峰會 #人神共憤 #比想像中可怕
稍稍看了賀建奎今日在人類基因組編輯峰會的演講與問答,腦子空白了一會,無法形容我有多憤怒,而我相信整個生物學界也是震怒,簡直能用人神共憤來形容。事件比想像中嚴重,賀建奎的品格及科學能力都低下,是沽名釣譽的垃圾。
賀建奎早前聲稱協助誕下兩位基因改造嬰孩,改造了(其實是移除了)CCR5基因,並宣稱他們是「愛滋免疫」。今天他在香港舉辦的人類基因組編輯峰會,正式發表結果。我大約總結一下一些重點,看看有否心情再撰文。
1.) 人類有兩套染色體,必須成功改造兩套才能完全敲除CCR5。兩位嬰孩中,只有一位是CCR5敲除,另一位,只有一套CCR5修改了,意思即是白做,不但沒用,還有健康風險。賀建奎明知的,照樣移植母體。
2.) 賀建奎宣稱改造CCR5安全,因為人類有一定人口擁有CCR5變種。然而,人類CCR5變種只是一種叫Delta32的變體,並非移除CCR5。賀建奎卻把嬰孩的CCR5基因敲除了。
3.) 只被改造一半的嬰孩,她被改造的CCR5,是個15bp移除變種,意思即是,她不單有一套正常的CCR5,無法防治HIV感染,還會有一個從未出現在人類基因的CCR5變種。完全無法預計有什麼效應,依然決心移植,實為瘋狂。
4.) 嬰孩的母親並無HIV感染,意思即是,就算不基因改造,嬰孩也不會感染HIV。賀建奎並無直接回答問題,只說成千上萬的人需要這實驗,並動之以情,講多少愛滋病人對人生失去希望,實驗有助重建他們希望。可見,是次實驗,並非醫療行為,是人類實驗。
5.)主持質疑現今科學界對CCR5認知太少,有研究證實CCR5敲除小鼠影響腦部發展,甚至提高了認知功能。賀建奎暗笑了一下(我覺得他暗笑了),並稱反對基改提升人類性能,但並沒有回答CCR5改造的潛在風險。
6.) 主持提及,CCR5變種只在北美及歐洲出現,在漢人之中甚少,有一定可能是因為CCR5變種在漢人基因下,因為生存不利而被淘汰,問賀建奎有否考慮相關風險。賀建奎並無回答。
7.) 病人的同意書,除了賀建奎團隊,就只有四個人審核過。
8.) 賀建奎原本正在進行更多基因改造人類移植,唯全球的反應令他們暫停了實驗。
9.) 賀建奎曾嘗試製造CCR5改造獼猴胚胎,但他們並沒有移植胚胎,檢視CCR5敲除獼猴有否健康問題,就直接造基因改造人。
10.) 賀建奎聲稱是次實驗並無脫靶效應。(不過中靶打中CCR5的後果已夠可怕)
11.) 賀建奎說他感到很自豪。
我只能說,賀建奎絕對是好大喜功的人,隨隨便便就拿基改胚胎移植。他沒有任何技術的貢獻,這些技術都是早就有的。但他不計任何風險,一意孤行製造基因改造人類。這絕對是不人道,且科學價值低的實驗,我期望科學界及社會強烈譴責賀建奎及是次實驗。如果連這種水平的基改人實驗也接受,我無法想像會有什麼後果。
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賀建奎不但卑鄙無恥,他還是個腦殘實驗的設計者!

【中國基因改造人,連碩士生都不如的實驗設計】
中國科學家製造基因改造人,是最近的熱門話題,大家應該不難找到,不過有些奇妙的地方,尤其是實驗設計,即使是專業科學新聞都難以見到。
《替基因寫一本史記-基因:人類最親密的歷史》
http://neanderthaldna.pixnet.net/blog/post/222437934
實驗是否成功,其實不能確定。不過由已知訊息看來,我覺得計劃領導贺建奎的實驗設計,非常非常非常的不知所云,是那種碩士生講出來,會直接被指導教授退回的等級。
首先,這種實驗現在是不能做的,相關規範請見 北歐心科學 NordicHearts 的整理:
https://www.facebook.com/…/a.15870224748…/2213809245528398/…
「美國國家科學院在二零一五年,籌組了基改人類的倫理籌委 [4]。各國都開始允許有限度的基因改造人類胚胎研究,大前提是禁止將基改胚胎發展成胎」
「在幾項條件下,可以接受基改人類胚胎的臨床測試。我列出其中幾項:
1)沒有合理的替代方法;
2)局限於治療嚴重疾病;
3)有充份證據證明該基因能直接並有效導致該疾病發生;
4)只能改造成已知人類的基因版本,並且無相關副作用;
5)充份臨床前試驗確保安全。」
~~~~~~
即使是以中國檯面上的標準,大概也是不行的,其中很有偽造的味道:
https://www.yicai.com/news/100067069.html
「根据《申请书》可以发现,有七人在该文件上签字,日期为2017年3月7日。不过,上述七人之中有一位委员26日下午接受了第一财经记者时表示对于此事并不知情。」
「签名的七个委员中,至少有4个与深圳和美医院的医生同名,其他三位因为字体无法辨认,无从分辨。」
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至於你說道德、法律趕不上科技,我想這樣講的人,應該看不懂這裡的「科技」長怎樣。
贺建奎的實驗設計非常奇怪,他拍攝惹一系列影片,大家可以自己觀摩。我覺得這個人腦袋太奇怪惹,應該追溯他從小到現在一路的學術培養,徹底掃蕩清理。
疾病分兩種,一種是「遺傳性疾病」,另一種是「傳染性疾病」。像是杭廷頓舞蹈症是遺傳的,天生就有;感冒則是傳染的,要感染才有。
用基因改造治療疾病,即使毫無專業知識的路人,也覺得是針對遺傳性疾病吧?遺傳性疾病那麼多,致病基因清楚的一大堆,隨便選都有,結果他選的是 AIDS,傳染性疾病 XDDDDDDD
基因改造健康的人,預防不容易碰上的傳染病,哪來的天才?
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他的做法更好笑。他直接把健康胚胎細胞的 CCR5 基因消滅,如此一來,這個人出生以後,一輩子都將缺乏這個基因。
概念是,假如一個人出生時沒有腦袋,一輩子都不會腦殘。
*這裡有些問題,一些報導指出,他不是把 CCR5 基因直接除掉,而是把此一基因改造後,換成另一個版本 CCR5Δ32。問題是,這種作法的失敗機率應該不低,對照他聲稱的成功率,極不合理。(另外也別忽略,改造失敗的胚胎,儘管尚未發育成人,仍是死掉惹)
**結果是我想太多,這個人太奇葩惹 LOL
https://www.facebook.com/…/a.15870224748…/2214950322080957/…
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贺建奎自稱,被改造過的人,可以終身免於 AIDS 威脅(這點其實有問題,不過先不管),但是要達到此一目的,隨便選一個人都可以,他選來實驗的對象,卻是 7 對特定條件的夫妻。
條件是「爸爸有 AIDS,媽媽沒有」,再用試管嬰兒的方式,把基因改造過的胚胎,擺進母體受孕,有一組雙胞胎順利出生。
哪裡來的智障!AIDS 是傳染性疾病,嬰兒本來就不會得病。我本來還以為,這是想免於母體內垂直感染的問題,結果一看,所有媽媽都沒有 AIDS 啊!這樣也不會有母體感染的問題,所以他到底想幹什麼?
贺建奎的實驗設計,簡直匪夷所思,姑且不論這類實驗不能做,光是看到他的實驗設計,腦袋正常的審查者就會退回惹。
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另一方面,基因改造是一回事,事後他要怎麼知道經過基因改造的人,確實不會得到 AIDS?再試圖用 HIV 感染測試嗎?天啊!
比起任何天然疾病,腦殘行為都更加嚴重,何況是有專業基因改造技術的腦殘?這事絕對不能善了。
Nature 新聞:
《Genome-edited baby claim provokes international outcry》:
https://www.nature.com/articles/d41586-018-07545-0
Science 新聞
《CRISPR bombshell: Chinese researcher claims to have created gene-edited twins》:
http://www.sciencemag.org/…/crispr-bombshell-chinese-resear…


NEANDERTHALDNA.PIXNET.NET
拿起《基因:人類最親密的歷史》(The Gene: An Intimate History)第一個感覺是,這本 600 多頁的書好重啊!作者顯然有很多話想說。 在這個講究速成、耐心缺乏的年代

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這個沽名釣譽的人渣!
全球首例基因編輯嬰兒誕生的新聞讓第二屆人類基因組編輯國際峰會受到了前所未有的關註,備受爭議的中國「基因編輯嬰兒」項目負責人賀建奎現身發言。與會者提出哪些問題?賀建奎回答了哪些問題?他迴避了哪些問題?BBC中文整理出賀建奎和現場觀眾問答互動時的文字內容: https://bbc.in/2E1kVz5
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這是很普通的基因編輯技術,只是別人都不會也不敢用在人類胚胎上,所以「基因改造寶寶」,很可能真的出生了,而且還是雙胞胎。天哪!再經過自然繁衍,這些編輯過的基因,就會進入人類基因庫!
「中國社群媒體微博帳號「知識份子」二十六日貼出一百二十二名學者連署聲明全文,強烈譴責賀建奎宣稱成功完成的基因編輯訂製寶寶,「這項所謂研究的生物醫學倫理審查形同虛設,直接進行人體實驗,只能用『瘋狂』來形容」。聲明指賀建奎採用的「常間回文重複序列叢集關聯蛋白系統」(CRISPR)基因剔除技術,因其準確性和定位失誤、對實驗對象未來影響未明等「脫靶效應」,在學界仍有很大爭議;因此,全球生醫界技術上早就做得到,卻不願或不敢做。」



NEWS.LTN.COM.TW
中國科學家賀建奎近日宣稱,已利用基因技術訂製出全球首例對愛滋病免疫的基因編輯寶寶,引發學界嚴厲撻伐。賀建奎今天如期於香港出席基因編輯國際峰會發表演說,他先針對引發的爭議致歉,接著承認,其研究數據未受他...

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《2018.12.3更新》
盲眼的尼安德塔石器匠
21 小時
【CRISPR怎麼改造基因,中國基改人到底改成怎樣?】
中國基因改造人震撼世界, 北歐心科學 NordicHearts 說「賀建奎的品格及科學能力都低下,是沽名釣譽的垃圾」,現在看來,批判仍是太輕。
《替基因寫一本史記-基因:人類最親密的歷史》
http://neanderthaldna.pixnet.net/blog/post/222437934
隨著愈來愈多細節流出,基因改造人的內幕,看起來實在很噁心。這邊是科普網站,我覺得基因改造的科學,以及讓悲劇上演的中國社會背景,都值得討論。
不過光是解釋基因改造,篇幅已經很長,希望各位看惹能夠增長知識。至於事件的背景,賀建奎怎麼利用中國法律、社會體系、人性的弱點,之後再來介紹。一句話,噁心。
〖生殖細胞或體細胞,改造意義完全不一樣〗
我們全身所有細胞,都源自於父母的精卵結合後,形成的胚胎,一次一次細胞分裂而成。如果改變胚胎的 DNA 序列,這些改變將跟著這個人一輩子,還會繼續遺傳給後代。
改變不會影響後代的「體細胞」,例如免疫細胞、血球、皮膚、神經元的基因來治療疾病,許多科學家樂觀其成。
但是改變「生殖細胞」完全不同,生殖細胞一旦改變,影響的不只是這個人自己,而是世世代代,受到多數科學家強烈反對。
〖CRISPR 怎麼基因改造?一難一易 2 種策略〗
CRISPR-Cas9 這種基因改造,或基因編輯的方式,儘管已經是史上最佳,仍然沒有那麼容易。CRISPR 基因改造有 2 種方式。一種是破壞目標,相對簡單;另一種是精確改變目標的 DNA 序列,難得多。
《CRISPR:原核生物的後天免疫系統與其他》
http://neanderthaldna.pixnet.net/blog/post/32437608
破壞目標,是 CRISPR 的天職,細菌就是用它殺死入侵的病毒;但是要做基因改造,當然不能把細胞殺死(手術成功,但是病人死掉惹!)
用 CRISPR 破壞基因,之所以能夠成功,是因為細胞內建有修理機制,DNA 要是斷掉,會趕快修復。但是搶救修理,常常會忙中出錯,即使能把斷掉的 DNA 接上,序列也變得跟本來不一樣-這就是 CRISPR 要的效果啦啦啦~
精確改變目標,比單純破壞難得多。原理簡單說,就是在破壞目標的同時,很好心的同時給予另一段 DNA 序列,讓細胞在修理的時候,使用人為給予的那段序列作材料。
如此一來,等到修理完畢,那段想要的 DNA 序列,就會成為細胞基因組的一部份。然而,破壞歸破壞,細胞不一定會用人為提供的材料修理,即使用惹,修出來的結果也不見得和設計一樣。
CRISPR 只搞破壞簡單,成功率高,但是改換成人類想要的序列,需要更多步驟,難度更難,失敗率高。若是兩條染色體都要精準修改,難度是相乘,失敗機率更高。
〖CCR5 基因和 AIDS 有什麼關係?〗
前天講過,AIDS 的病毒感染細胞時,CCR5 基因的產物參與其中。人每一條染色體都是一對,所以基因組中有 2 個一樣的基因,一個人會有 2 個 CCR5。
之前知道歐洲族群中,有 10% 的人,配備此一基因的變異:CCR5 delta-32;所以天然狀況下,有 1% 的歐洲人(10% × 10%),同時配備 2 個改版 CCR5,而不會被某些 AIDS 病毒感染。
但是 AIDS 的病毒很多款,有些仍有感染能力,所以賀建奎改造此一基因想要避免 AIDS,出發點就是錯的(他真的不太懂愛滋,不是我說的)。另一方面,CCR5 是人體正常所需的基因,把它完全消滅,後果難料。
〖中國基因改造人的 CCR5 被改成?〗
賀建奎創造的 2 位基改寶寶,改造後的 CCR5 基因序列如圖,資料來自馬薩諸塞大學醫學院(University of Massachusetts Medical School)的 Sean Ryder 的推特:
https://twitter.com/RyderLab/status/1068128997656207361
圖中共有 5 個序列,最上面是一般的 CCR5,第二個是改版 CCR5 delta-32,兩者都是天然的存在。下面 3 個,分別是 2 位基改嬰兒,露露與娜娜的基因(可憐的寶寶 Q Q )。
基因中每 3 個 DNA 位置,對應一個氨基酸。基因序列中間,如果少掉,或多出一段「3 的倍數」的話(例如 15、21、39),應該還是能製造出跟本來類似的產物,只是蛋白質中間會少掉,或是多出一段。
*如果你學過分子生物學的話,我這邊幾個「DNA 位置」都是「nucleotide(核苷酸)」的意思,請自行代換 ^ ^
蛋白質中間,多出或少掉一段,造成的影響不一定,可能完全沒有影響,假如改變惹關鍵位置,卻也可能完全失去功能。其中一位改造人露露,一個 CCR5 沒有改變;另一個 CCR5 基因的中間,少掉 15 個 DNA 位置,因此應該仍能製造蛋白質,只是影響未知。
以實驗設計來說,改造人露露算是改造失敗,本來不該出生,賀建奎卻表示,她的父母希望她出生。也許這不是謊言,但是背後的真相,恐怕恰好印證出,賀建奎這個人有多麼惡質。(改天再解釋)
〖改造人娜娜沒有 CCR5,卻有 2 種突變產物〗
DNA 以 3 個 3 個的順序變成蛋白質,如果基因中間少掉,或多出「不是 3 的倍數」的話(例如 1、16、41),被改變的基因,或許仍能產出蛋白質,可是序列卻會和原本完完全全不一樣。(天然存在的改版 CCR5 delta-32,少掉 32 就是如此)
少數狀況下,即使蛋白質後方序列和本來不一樣,也能維持原本的作用。但是大多時候,這類產物不會保有功能,更糟糕的是,序列和本來不同的蛋白質,也許會帶來危害,導致難以預料的影響。
另一位改造人娜娜,2 個 CCR5 基因都被改變,而且改法不一樣。她 CCR5 中間的 DNA 序列,一個基因少掉 4 個,另一個基因多出 1 個,使得她不能製造本來的 CCR5 蛋白質,卻會製造 2 種不一樣的突變產物,2 種!
她沒有正常的 CCR5,還會製造 2 種新的突變蛋白質,影響未知。即使參考天然存在的變異 delta-32,多出 1 個 DNA 的改變,似乎平時不影響健康,別忽略她還配備另一個,少掉 4 個 DNA 的 CCR5 基因,突變產物前所未見。
〖賀建奎,空有博士學位,毫無專業的白癡〗
由這點能再度看出,賀建奎的專業能力非常爛,真的是白癡中的白癡。
如果目的是消滅 CCR5 基因,那麼根本不應該把 CRISPR 攻擊的目標,設計在基因的中間,而是要設計在基因的開頭,讓整個基因做不出產物,避免突變蛋白質的問題。他是個博士,連這種常識都沒有!
如果目的是,想要把 CCR5 改換成,天然存在的改版 CCR5 delta-32 呢?
那麼也完全不應該把 DNA 改變的位置,設計在基因裡面。而是要把 CRISPR 的攻擊位置,擺在基因外面的前後兩端,再同時給予細胞一整段,包含 CCR5 delta-32 的序列,讓細胞在修理的時候,把整段想要的基因序列順便塞進去,才能避免問題。(用 CRISPR 做精準修改,忘記的話往上滑復習一下)
寫得好長啊,希望大家看完以後,能更深入認識一些基因改造的知識,了解正確的 CRISPR 基因編輯是怎麼做,不學無術的賀建奎,又是怎麼亂搞。